通用型氣相色譜儀水質分析采用氣體作為流動相對分析物質進行色譜分析。主要用于低分子量易揮發有機化合物的分析，在地表水環境質量標準中，80項生活飲用水特定項目的分析中有57項采用氣相色譜法。氣相色譜法具有(1)分離效率高(2)靈敏度高(3)選擇性高 (4)分析速度快(5)應用范圍廣的特征

通用型氣相色譜儀水質分析在水質監測化學污染物的檢測領域中，主要用于有機氯農藥、有機磷農藥、有機化學污染物及微量金屬元素的監測。

有機氯農藥是神經毒，又是一種肝毒。有機氯農藥的殘效期特別長，不易分解，對環境造成嚴重污染，而且具有致畸等不良后果。氣相色譜儀配置電子捕獲檢測器，用內徑2～3．5mm、長1．8～2m的硬制玻璃柱， 內裝Chromosorb WAWDMCS 80—100目，涂OV一17為1．5％，QF一1為1．95％，設柱溫180℃ ，汽化室溫度200℃，檢測器溫度220℃ ，氮載氣(≥99．999％)流速為60mL／min，可檢測水體中的“六六六” (含4種異構體，可檢測至4ng／L)和DDT (含4種異構體，可檢測至200ng／L)以及艾試劑、七氯、硫丹等有機氯農藥成份。 

氣相色譜法不僅是分析檢測有機污染物*的重要方法，近年來，在分析水體中某些微量金屬元素方面也取得了一定的發展。現在能夠利用氣相色譜法分析的金屬元素有硒、鈹、銅等。分析檢測硒的方法是利用1，2一領苯二胺或衍生物在酸性溶液中與四價硒反應，當O～PDA試劑足夠量時，可定量地生成揮發性的、可被有機萃取為苯丙硒二唑化合物，然后利用帶電子捕獲檢測器的氣相色譜儀測定其含量。