高密度RNA微芯片可實現更高效生產
【化工儀器網 時事熱點】大約40年前，人們開發出了一種化學合成DNA和RNA的方法，即使用亞磷酰胺化學法從DNA或RNA構建塊合成任何序列。這種方法在微芯片的生產中也有應用，能夠在指甲蓋大小的固體表面上同時合成和分析海量序列。然而，由于RNA的穩定性較差，該技術應用于RNA微芯片時面臨很大困難。
奧地利維也納大學領導的國際研究小組成功開發出一種具有更高化學反應性和光敏性的RNA構建模塊，其可以顯著縮短用于生物技術和醫學研究的RNA芯片的生產時間。這些芯片的生產時間可縮短一半，效率提高7倍。該研究成果7月31日發表在《科學進展》雜志上。
本次研發的全尺寸高密度RNA微芯片大小與指甲蓋相當，可容納多達780000個獨特的RNA序列，每個序列占據約14 x14μm²的面積。可通過添加帶有綠色熒光標簽的互補DNA鏈來驗證RNA的存在和質量。
大約40年前，人們開發出一種化學合成DNA和RNA的方法，使用亞磷酰胺化學法可從DNA或RNA構建塊合成任何序列。使用這些特殊的化學構建塊，可以逐步組裝核酸鏈。每個構建塊都帶有化學“保護基”，可以防止不必要的反應。
這種化學方法還用于微芯片的生產，其在指甲蓋大小的固體表面上同時合成和分析海量序列。但由于RNA的穩定性較差，該技術應用于RNA微芯片面臨很大困難。
維也納大學無機化學研究所團隊與法國蒙彼利埃大學馬克斯·穆塞隆生物分子研究所合作，開發出一種新型RNA構建模塊，可大大縮短RNA芯片的生產時間。全尺寸高密度RNA微芯片可容納多達780000個獨特的RNA序列，每個序列占據約14×14μm2的面積。
論文介紹了一項關于RNA適體(特異性結合靶分子的小寡核苷酸)的研究。研究人員選擇了兩種與染料結合后產生熒光的“發光”適體，并在芯片上合成了數千種適體的變體。一次實驗足以同時獲得所有變體的數據，這為鑒定具有更好診斷特性的改進適體開辟了道路。
在當前飛速發展的非侵入性分子診斷領域，高質量的RNA芯片尤其有價值。RNA適體將是其最直接的應用之一，例如能夠實時跟蹤激素水平，或直接從汗水或唾液中監測其他生物標志物。
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