我國研發(fā)CoHIT檢測平臺：一種簡便、快速、精準(zhǔn)的CRISPR基因檢測技術(shù)
【化工儀器網(wǎng) 項目成果】中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所(嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實驗室深圳分中心)攜手武漢大學(xué)中南醫(yī)院，在《自然·通訊(Nature Communications)》期刊上發(fā)表了一項重大研究成果。該論文題為“CoHIT: a one-pot ultrasensitive ERA-CRISPR system for detecting multiple same-site indels”，介紹了一種名為CoHIT的新型CRISPR檢測平臺，該平臺能夠快速、精準(zhǔn)地檢測同一基因位點上多種不同類型的突變(indels)。
快速靈敏檢測技術(shù)對疾病防控必不可少近年來，以CRISPR/Cas為代表的基因編輯技術(shù)帶來了生物技術(shù)革命性的進步。CRISPR的核酸檢測技術(shù)因其快速、準(zhǔn)確、靈敏、經(jīng)濟等特點，正在引發(fā)分子診斷革新，并已被成功應(yīng)用于傳染病、遺傳病、腫瘤基因突變診斷，以及食品安全等領(lǐng)域。
但現(xiàn)有的檢測方法在應(yīng)對同一基因位點的多種indels時往往存在檢測覆蓋率不足的局限性。為了克服這一挑戰(zhàn)，研究團隊利用蛋白進化技術(shù)，篩選出高耐受度的Cas蛋白，并結(jié)合單一crRNA識別多種突變類型的創(chuàng)新理念，成功構(gòu)建了CoHIT檢測平臺。
CoHIT系統(tǒng)的核心在于一種改良的AsCas12a蛋白，即enAsU-R。這種蛋白僅需一條crRNA就能靶向多個不同的變異體，有效提高了檢測的靈敏度和特異性。通過一系列參數(shù)優(yōu)化，CoHIT技術(shù)對NPM1基因突變的常見亞型達(dá)到了0.01%的檢測靈敏度，并在30分鐘內(nèi)快速給出結(jié)果，為急性髓系白血病(AML)患者的NPM1突變檢測提供了新的解決方案，且在監(jiān)測微小殘留病灶(MRD)方面展現(xiàn)了巨大的潛力。
值得一提的是，CoHIT技術(shù)還具備出色的適應(yīng)性和多重檢測能力。通過與側(cè)向流檢測條(LFA)和微流控芯片的結(jié)合，該技術(shù)不僅實現(xiàn)了現(xiàn)場快速檢測，還能夠在一次上樣中同時檢測多個靶標(biāo)，為疾病的早期診斷和食品安全監(jiān)測等領(lǐng)域提供了強大的技術(shù)支持。
CoHIT技術(shù)的成功研發(fā)和不斷優(yōu)化，不僅簡化了檢測流程，還大大提升了檢測速度與準(zhǔn)確性，為分子育種、疾病早期診斷、遺傳病篩查和食品安全監(jiān)測等眾多領(lǐng)域提供了強有力的工具。
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